1、购买农产品时，除了获得增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书外，还应根据农产品收购发票或销售发票上标明的买价以及9%的扣除率来计算进项税额。计算公式为：进项税额 = 买权价 × 扣除率。
2、政策依据：《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条规定，目前按照9%的比例进行抵扣。如果是生产活动，还可以额外加扣1%。具体到会计分录中，可以抵扣的进项税额计算如下：原材料成本 × 1%。
3、自2019年4月1日起，增值税税率进行了调整，其中农产品适用税率被定为9%。对于之前适用10%扣除率的情况，这一比例也相应调整至9%。针对农产品深加工行业的特点，《财政部 税务总局 海关总署关于增值税改革有关政策的公告》（即39号公告）特别规定，当纳税人购进用于生产或委托加工13%税率货物的农产品时，其进项税额应按10%的扣除率计算，这意味着在农产品深加工领域享有额外的1%加计扣除优惠。