个人所得税经营所得的网上申报可以通过两种方式进行：一种是通过自然人电子税务局扣缴端进行代理申报，另一种是由投资人或业主自己在自然人电子税务局WEB端上自行申报。
1. 自然人电子税务局扣缴端代理申报：本单位办税人员可以登录自然人电子税务局扣缴端后，点击顶部“生产经营”进入申报模块。在左边工具栏中，点击“预缴纳税申报”等选项，即可进入相关申报缴款界面。
2. 自然人电子税务局WEB端自行申报：业主或投资人可以打开国家税务总局深圳市税务局官网首页，点击“自然人电子税务局”进入登录界面。首次登录需要进行实名认证。登录后点击【我要办税】-【税费申报】进入申报界面，选择相应的申报表填报。
需要注意的是，在自然人电子税务局扣缴端完成经营所得个人所得税申报后，可以通过以下四种方式办理税款缴款：个人三方协议扣缴税款、银行端查询缴税、银联缴税和扫码缴税（包括支付宝扫码、微信扫码和云闪付）。而在自然人电子税务局WEB端完成经营所得个人所得税申报后，可以通过以下三种方式办理税款缴纳：个人三方协议扣缴税款、银联缴税和扫码缴税（包括支付宝扫码、微信扫码和云闪付）。
1. 自然人电子税务局扣缴端代理申报：本单位办税人员可以登录自然人电子税务局扣缴端后，点击顶部“生产经营”进入申报模块。在左边工具栏中，点击“预缴纳税申报”等选项，即可进入相关申报缴款界面。
2. 自然人电子税务局WEB端自行申报：业主或投资人可以打开国家税务总局深圳市税务局官网首页，点击“自然人电子税务局”进入登录界面。首次登录需要进行实名认证。登录后点击【我要办税】-【税费申报】进入申报界面，选择相应的申报表填报。
需要注意的是，在自然人电子税务局扣缴端完成经营所得个人所得税申报后，可以通过以下四种方式办理税款缴款：个人三方协议扣缴税款、银行端查询缴税、银联缴税和扫码缴税（包括支付宝扫码、微信扫码和云闪付）。而在自然人电子税务局WEB端完成经营所得个人所得税申报后，可以通过以下三种方式办理税款缴纳：个人三方协议扣缴税款、银联缴税和扫码缴税（包括支付宝扫码、微信扫码和云闪付）。
